Biomarkery časné diagnózy maligního onemocnění, prognózy pacienta a odpovědi na léčbu
Vedoucí skupiny: Veronika Vymetálková
Uzel Praha
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
Ústav experimentální medicíny AV ČR
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 3 - Biomarkery nádorových nemocí a diagnostika nádorových chorob
Osvětli neznámé, aplikuj poznatky a zlepši výsledky pacientů s nádorovým onemocněním.
- Mise: Posunout precizní onkologii prostřednictvím molekulární charakterizace nádorových buněk, objevování biomarkerů a vývoje neinvazivních diagnostických metod a strategií monitorování pacientů.
- Vize: Zlepšit výsledky léčby pacientů převáděním špičkového molekulárního výzkumu do účinných nástrojů pro včasnou detekci rakoviny, predikci prognózy a personalizovanou terapii.
Zaměřujeme se na molekulární charakterizaci maligních onemocnění, přičemž hlavní důraz klademe na kolorektální a pankreatické nádory. K dosažení tohoto cíle provádíme špičkové molekulárně-epidemiologické studie, jejichž cílem je identifikovat biomarkery spojené s predispozicí k nádorovému onemocnění, včasnou detekcí, odpovědí na léčbu, chemorezistencí a dlouhodobou prognózou.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Jungwirth J, Urbanova M, Boot A, Hosek P, Bendova P, Siskova A, Svec J, Kment M, Tumova D, Summerova S, Benes Z, Buchler T, Kohout P, Hucl T, Matej R, Vodickova L, van Wezel T, Vodicka P, Vymetalkova V. Mutational analysis of driver genes defines the colorectal adenoma: in situ carcinoma transition. Sci Rep. 2022 Feb 16;12(1):2570. DOI: 10.1038/s41598-022-06498-9
- Horak J, Kubecek O, Siskova A, Honkova K, Chvojkova I, Krupova M, Manethova M, Vodenkova S, García-Mulero S, John S, Cecka F, Vodickova L, Petera J, Filip S, Vymetalkova V. Differences in genome, transcriptome, miRNAome, and methylome in synchronous and metachronous liver metastasis of colorectal cancer. Front Oncol. 2023 Apr 27;13:1133598. doi: 10.3389/fonc.2023.1133598
- Bendova P, Pardini B, Susova S, Rosendorf J, Levy M, Skrobanek P, Buchler T, Kral J, Liska V, Vodickova L, Landi S, Soucek P, Naccarati A, Vodicka P, Vymetalkova V. Genetic variations in microRNA-binding sites of solute carrier transporter genes as predictors of clinical outcome in colorectal cancer. Carcinogenesis. 2021 Apr 17;42(3):378-394. DOI: 10.1093/carcin/bgaa136
- Pardini B, Ferrero G, Tarallo S, Gallo G, Francavilla A, Licheri N, Trompetto M, Clerico G, Senore C, Peyre S, Vymetalkova V, Vodickova L, Liska V, Vycital O, Levy M, Macinga P, Hucl T, Budinska E, Vodicka P, Cordero F, Naccarati A. A Fecal MicroRNA Signature by Small RNA Sequencing Accurately Distinguishes Colorectal Cancers: Results From a Multicenter Study. Gastroenterology. 2023 Sep;165(3):582-599.e8. doi: 10.1053/j.gastro.2023.05.037
- Cervena K, Novosadova V, Pardini B, Naccarati A, Opattova A, Horak J, Vodenkova S, Buchler T, Skrobanek P, Levy M, Vodicka P, Vymetalkova V. Analysis of MicroRNA Expression Changes During the Course of Therapy In Rectal Cancer Patients. Front Oncol. 2021 Sep 2;11:702258. DOI: 10.3389/fonc.2021.702258
SPOLUPRÁCE V NÚVR
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Omics (WES, RNASeq, smallRNASeq apod.)
Tekutá biopsie
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY
Národní infrastruktura pro translační medicínu EATRIS-CZ