Pavel Vodička

Molekulární biologie nádorů: Biomarkery prognózy nádorových onemocnění a predikce léčebných intervencí

Vedoucí skupiny: Pavel Vodička
Uzel Praha

pavel.vodicka@iem.cas.cz
webové stránky pracoviště

DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ

Ústav experimentální medicíny AV ČR

VÝZKUMNÝ PROGRAM

VP 3 - Biomarkery nádorových nemocí a diagnostika nádorových chorob

Nádor je mnohotvárný a zhoubný protivník, ale i společník.

ZAMĚŘENÍ A CÍLE VÝZKUMU
VYBRANÉ PUBLIKACE
EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
SPOLUPRÁCE V NÚVR
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR
  • Mise: Podchytit nádorovou progresi a identifikovat biomarkery prognózy pacientů a jejich individuální odpovědi na protinádorovou léčbu.
  • Vize: Porozumění nádorové progresi spolu se zmapováním prognózy a predikce u onkologických pacientů by mělo napomoci efektivnější terapii.

Budeme identifikovat řadu molekulárních parametrů charakterizujících modifikace genetické informace, tj. poškození DNA, nebo změny v regulaci genové exprese, včetně epigenetických charakteristik (exprese miRNA, metylace DNA) v souvislosti s genomickou instabilitou u nádorů trávicího traktu (kolorektum, slinivka břišní) a ovarií. Budeme mapovat progresi nádorových onemocnění – počínaje primárním nádorem a vzdálenými metastázami konče. Porovnávány budou rovněž synchronní a metachronní metastázy v souvislosti s další prognózou pacienta. Budeme studovat biomarkery, které umožní individuální posouzení odpovědi pacienta na léčbu. V tomto kontextu se zaměříme na odhalování příčin chemorezistence, jež zásadní příčinou úmrtnosti na nádorová onemocnění.

VYBRANÉ PUBLIKACE
  • Vodickova L, Horak J, Vodicka P. Genetic Susceptibility in Understanding of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Risk: A Decade-Long Effort of the PANDORA Consortium. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2022 May 4;31(5):942-948. DOI: 10.1158/1055-9965.EPI-21-1340
  • Cervena K, Novosadova V, Pardini B, Naccarati A, Opattova A, Horak J, Vodenkova S, Buchler T, Skrobanek P, Levy M, Vodicka P, Vymetalkova V. Analysis of MicroRNA Expression Changes During the Course of Therapy In Rectal Cancer Patients. Front Oncol. 2021 Sep 2;11:702258. DOI: 10.3389/fonc.2021.702258
  • Pistoni L, Gentiluomo M, Lu Y, López de Maturana E, Hlavac V, Vanella G, Darvasi E, Milanetto AC, Oliverius M, Vashist Y, Di Leo M, Mohelnikova-Duchonova B, Talar-Wojnarowska R, Gheorghe C, Petrone MC, Strobel O, Arcidiacono PG, Vodickova L, Szentesi A, Capurso G, Gajdán L, Malleo G, Theodoropoulos GE, Basso D, Soucek P, Brenner H, Lawlor RT, Morelli L, Ivanauskas A; PanGenEU Study Investigators, Kauffmann EF, Macauda A, Gazouli M, Archibugi L, Nentwich M, Loveček M, Cavestro GM, Vodicka P, Landi S, Tavano F, Sperti C, Hackert T, Kupcinskas J, Pezzilli R, Andriulli A, Pollina L, Kreivenaite E, Gioffreda D, Jamroziak K, Hegyi P, Izbicki JR, Testoni SGG, Zuppardo RA, Bozzato D, Neoptolemos JP, Malats N, Canzian F, Campa D. Associations between pancreatic expression quantitative traits and risk of pancreatic ductal adenocarcinoma. Carcinogenesis. 2021 Aug 19;42(8):1037-1045. DOI: 10.1093/carcin/bgab057
  • Corlin L, Ruan M, Tsilidis KK, Bouras E, Yu YH, Stolzenberg-Solomon R, Klein AP, Risch HA, Amos CI, Sakoda LC, Vodička P, Rish PK, Beck J, Platz EA, Michaud DS. Two-Sample Mendelian Randomization Analysis of Associations Between Periodontal Disease and Risk of Cancer. JNCI Cancer Spectr. 2021 Apr 19;5(3):pkab037. DOI: 10.1093/jncics/pkab037
  • Galeotti AA, Gentiluomo M, Rizzato C, Obazee O, Neoptolemos JP, Pasquali C, Nentwich M, Cavestro GM, Pezzilli R, Greenhalf W, Holleczek B, Schroeder C, Schöttker B, Ivanauskas A, Ginocchi L, Key TJ, Hegyi P, Archibugi L, Darvasi E, Basso D, Sperti C, Bijlsma MF, Palmieri O, Hlavac V, Talar-Wojnarowska R, Mohelnikova-Duchonova B, Hackert T, Vashist Y, Strouhal O, van Laarhoven H, Tavano F, Lovecek M, Dervenis C, Izbéki F, Padoan A, Małecka-Panas E, Maiello E, Vanella G, Capurso G, Izbicki JR, Theodoropoulos GE, Jamroziak K, Katzke V, Kaaks R, Mambrini A, Papanikolaou IS, Szmola R, Szentesi A, Kupcinskas J, Bursi S, Costello E, Boggi U, Milanetto AC, Landi S, Gazouli M, Vodickova L, Soucek P, Gioffreda D, Gemignani F, Brenner H, Strobel O, Büchler M, Vodicka P, Paiella S, Canzian F, Campa D. Polygenic and multifactorial scores for pancreatic ductal adenocarcinoma risk prediction. J Med Genet. 2021 Jun;58(6):369-377. DOI: 10.1136/jmedgenet-2020-106961
SPOLUPRÁCE V NÚVR

Ludmila Vodičková
(Praha uzel, Ústav experimentální medicíny AV ČR)

Pavel Rössner
(Praha uzel, Ústav experimentální medicíny AV ČR)

SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE

Digitální PCR

Fluorescenční mikroskop

Western blott

RT PCR

NGS technologie

ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY

Národní infrastruktura pro translační medicínu EATRIS-CZ