Funkční genomika
Vedoucí skupiny: Michal Šmída
Uzel Brno
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
CEITEC MU
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 1 - Molekulární podstata nádorových chorob a molekulární cíle
VP 2 - Výzkum a vývoj protinádorových léčiv a terapeutických postupů
I nádory mají Achillovu patu! Jen ji najít!
- Mise: Popsat mechanismy rezistence leukémií na současnou léčbu a identifikovat nové molekulární cíle terapie.
- Vize: Navrhnout inovativní možnosti léčby s vylepšenou účinností.
Zabýváme se identifikací nových farmakologických cílů, které by mohly být využity v klinické praxi jako inovativní cílené terapie, se zaměřením na dvě nejčastější hematologické malignity – chronickou lymfocytární leukémii (CLL) a akutní myeloidní leukémii (AML). Technologie CRISPR/Cas9 spolu s lentivirovou infekcí je využita k tvorbě buněčných modelů nesoucích nejčastější mutace nacházející se u pacientů. Funkční dopady těchto aberací na buněčnou signalizaci a chování jsou pečlivě analyzovány.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Ledererova A, Dostalova L, Kozlova V, Peschelova H, Ladungova A, Culen M, Loja T, Verner J, Pospisilova S, Smida M*, Mancikova V* (*shared authors). Hypermethylation of CD19 promoter enables antigen-negative escape to CART-19 in vivo and in vitro. J ImmunoTher Cancer. 2021 Aug;9(8):e002352. DOI: 10.1136/jitc-2021-002352
- Kozlova V, Ledererova A, Ladungova A, Janovska P, Slusarczyk A, Domagala J, Kopcil P, Vakulova V, Oppelt J, Bryja V, Doubek M, Mayer J, Pospisilova S, Smida M. CD20 is dispensable for B-cell receptor signaling but is required for proper actin polymerization, adhesion and migration of malignant B cells. Plos One. 2020 Mar 25;15(3):e0229170. DOI: 10.1371/journal.pone.0229170
- Mancikova V, Peschelova H, Kozlova V, Ledererova A, Ladungova A, Verner J, Loja T, Mayer J, Pospisilova S, Smida M. Performance of a-CD19 Chimeric Antigen Receptor T cells in genetically defined classes of Chronic Lymphocytic Leukemia. J ImmunoTher Cancer. 2020 Mar;8(1):e000471. DOI: 10.1136/jitc-2019-000471
- Smida M, Fece de la Cruz F, Uras IZ, van Jaarsveld R, Konopka T, Nagy-Bojarszky K, Muellner MK, Bago-Horvath Z, Haura EB, Loizou JI, Nijman SMB. MEK inhibitors block growth of Ataxia Telangiectasia Mutated (ATM) mutant lung tumors. Nature Communications. 2016;7, 13701. DOI: 10.1038/ncomms13701
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
CRISPR/Cas9 technologie, výroba knockout a knock-in linií
Celogenomový CRISPR/Cas9 knockout screening
Buněčný screening s knihovnami látek
Portfolio buněčně biologických metod, včetně lentivirové infekce
Genomické přístupy jako RNA sekvenace, ATACseq, single-cell RNA sekvenace
CAR-T cell technologie