Laboratoř strukturní biologie
Vedoucí skupiny: Cyril Bařinka
Uzel Praha
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
Biotechnologický ústav AV ČR
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 2 - Výzkum a vývoj protinádorových léčiv a terapeutických postupů
Poznej svého nepřítele, abys s ním mohl účinně bojovat.
- Mise: Základní výzkum molekulárních mechanismů patofyziologických procesů, který je aplikovatelný ve vývoji nových léčebných přístupů.
- Vize: Přispět zásadní měrou k pochopení molekulárních mechanismů karcinogeneze.
Karcinom prostaty (PCa) zůstává druhým nejčastějším zhoubným nádorem u mužů, a to i přes významný pokrok v diagnostice a léčbě. Prostatický specifický membránový antigen (PSMA) je transmembránová metaloproteáza, která se v klinické praxi používá k diagnostickému zobrazování a léčbě metastazujícího PCa. Zvýšená exprese PSMA je detekována také v neovaskulatuře neprostatických solidních nádorů, a vývoj ligandů specificky cílených na PSMA tak představuje atraktivní směr výzkumu v oblasti terapie a diagnostiky pevných nádorů.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Zhang J, Rakhimbekova A, Duan X, Yin Q, Foss CA, Fan Y, Xu Y, Li X, Cai X, Kutil Z, Wang P, Yang Z, Zhang N, Pomper MG, Wang Y*, Bařinka C*, Yang X*: A PSMA-activated molecular rotor for real-time fluorescence imaging. Nat Commun. 2021;12(1):5460. DOI: 10.1038/s41467-021-25746-6
- Ptacek J, Zhang D, Liu Q, Kruspe S, Motlova L, Kolenko P, Novakova Z, Shubham S, Havlinova B, Baranova P, Chen SJ, Zou X, Giangrande P, Barinka C: Structural Basis of Prostate-specific Membrane Antigen Recognition by the A9g RNA Aptamer. Nucl Acid Res. 2020;48(19):11130-11145. DOI: 10.1093/nar/gkaa494
- Noonepalle S, Shen S, Ptacek J, Tavares MT, Zhang G, Stransky J, Pavlicek J, Ferreira GM, Hadley M, Pelaez G, Bařinka C, Kozikowski A, Villagra A: Rational Design of Suprastat, a Novel Selective Histone Deacetylase 6 Inhibitor with the Ability to Potentiate Immunotherapy in Melanoma Models. J Med Chem. 2020;63(18):10246-10262. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.0c00567
- Kopka K, Benešová M, Barinka C, Haberkorn U, Babich J: Glu-Ureido–Based Inhibitors of Prostate-Specific Membrane Antigen: Lessons Learned During the Development of a Novel Class of Low-Molecular-Weight Theranostic Radiotracers. J Nucl Med. 2017;58:17S-26. DOI: 10.2967/jnumed.116.186775
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Tereza Ormsby
(uzel Praha, Ústav oragnické chemie a biochemie AV ČR)
Vítězslav Bryja
(uzel Brno, Přírodovědecká fakulta MU)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Produkce rekombinantních proteinů a jejich strukturní a funkční charakterizace
Proteinové inženýrství, vývoj protilátek
Vývoj aktivitních a diagnostických stanovení
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY
Biotechnologické a biomedicínské centrum Akademie věd ČR a Univerzity Karlovy BIOCEV
Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii CIISB
Národní infrastruktura pro chemickou biologii CZ-OPENSCREEN