Laboratoř hmotnostní spektrometrie
Vedoucí skupiny: Lenka Hernychová
Uzel Brno
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
Masarykův onkologický ústav
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 1 - Molekulární podstata nádorových chorob a molekulární cíle
VP 3 - Biomarkery nádorových nemocí a diagnostika nádorových chorob
Proteiny se před námi neschovají! Pomáháme odhalit tajné úmysly proteinů!
- Mise: Najít rozdíly na proteinové úrovni specifikující patofyziologické stavy.
- Vize: Specifikovat sady biomolekul vhodných pro výzkumné i klinické účely.
Proteomika tvoří most mezi genomikou a bioinformatikou.
Cílem klinické proteomiky je získávat detailní informace o kvalitativních i kvantitativních změnách proteinů ve studovaných proteomech a o jejich souvislostech s fyziologickými i patologickými změnami. Tyto znalosti lze využít k identifikaci markerů, které mohou umožnit časnou diagnostiku nebo predikovat odpověď nádorového onemocnění na terapii.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- O’Neill JR, Yébenes Mayordomo M, Mitulović G, Al Shboul S, Bedran G, Faktor J, Hernychova L, Uhrik L, Gomez-Herranz M, Kocikowski M, Save V, Vojtěšek B, Arends M; OCCAMS consortium; Hupp T, Alfaro J. Multi-omic analysis of Esophageal Adenocarcinoma uncovers candidate therapeutic targets and cancer-selective post-transcriptional regulation. Mol Cell Proteomics. 2024 Apr 9:100764. DOI: 10.1016/j.mcpro.2024.100764
- Nekulová M, Wyszkowska M, Friedlová N, Uhrík L, Zavadil Kokáš F, Hrabal V, Hernychová L, Vojtěšek B, Hupp TR, Szymański MR. Biochemical evidence for conformational variants in the anti-viral and pro-metastatic protein IFITM1. Biol Chem. 2024 Feb 22;405(5):311-324. DOI: 10.1515/hsz-2023-0327
- Benesova I, Nenutil R, Urminsky A, Lattova E, Uhrik L, Grell P, Kokas FZ, Halamkova J, Zdrahal Z, Vojtesek B, Novotny MV, Hernychova L. N-glycan profiling of tissue samples to aid breast cancer subtyping. Sci Rep. 2024 Jan 3;14(1):320. DOI: 10.1038/s41598-023-51021-3
- Nemergut M, Marques SM, Uhrik L, Vanova T, Nezvedova M, Gadara DC, Jha D, Tulis J, Novakova V, Planas-Iglesias J, Kunka A, Legrand A, Hribkova H, Pospisilova V, Sedmik J, Raska J, Prokop Z, Damborsky J, Bohaciakova D, Spacil Z, Hernychova L, Bednar D, Marek M. Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate. Mol Neurodegener. 2023 Jun 6;18(1):38. DOI: 10.1186/s13024-023-00620-9
- Toul M, Slonkova V, Mican J, Urminsky A, Tomkova M, Sedlak E, Bednar D, Damborsky J, Hernychova L, Prokop Z. Identification, characterization, and engineering of glycosylation in thrombolytics. Biotechnol Adv. 2023 Sep;66:108174. DOI: 10.1016/j.biotechadv.2023.108174
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Helena Kupcová Skalníková
(uzel Praha, 1. lékařská fakulta UK)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Proteomické analýzy (identifikace, kvantifikace proteinů, detekce posttranslačních modifikací)
Glykomika a glykoproteomika
Strukturní proteomika (HDX-MS)