Laboratoř onkogenetiky
Vedoucí skupiny: Zdeněk Kleibl
Uzel Praha
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
1. lékařská fakulta UK
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 4 - Včasná detekce a prevence nádorů
Nádory v genech a geny v nádorech.
- Mise: Mapování nádorové predispozice v ČR.
- Vize: Snížení incidence nádorů v ČR u osob s genetickou predispozicí.
Dědičné nádory představují specifickou podskupinu nádorových diagnóz charakterizovanou přítomností zárodečné genetické alterace postihující některý ze stovek charakterizovaných genů pro predispozici k nádorovým onemocněním. Nositelé patogenních variant těchto genů mají výrazně zvýšené riziko vzniku rakoviny a jejich nádory, které mohou vznikat ve výrazně mladším věku než jejich sporadické protějšky, mohou mít jedinečné klinické rysy způsobené odlišným biologickým chováním.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Hovhannisyan M, Zemankova P, Nehasil P, Matejkova K, Borecka M, Cerna M, Dolezalova T, Dvorakova L, Foretova L, Horackova K, Jelinkova S, Just P, Kalousova M, Kral J, Machackova E, Nemcova B, Safarikova M, Springer D, Stastna B, Tavandzis S, Vocka M, Zima T, Soukupova J, Kleiblova P, Ernst C, Kleibl Z, Janatova M. Population-specific validation and comparison of the performance of 77- and 313-variant polygenic risk scores for breast cancer risk prediction. Cancer. 2024 May 8. DOI: 10.1002/cncr.35337
- Stolarova L, Kleiblova P, Zemankova P, Stastna B, Janatova M, Soukupova J, …, Macurek L, Kleibl Z. ENIGMA CHEK2gether project: a comprehensive study identifies functionally-impaired CHEK2 germline missense variants associated with increased breast cancer risk. Clin Cancer Res. 2023;29(16):3037-3050. DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-23-0212
- Yang X, Leslie G, Doroszuk A, …, Kleibl Z, Kleiblova P, … Soukupova J, …Janatova M,…Tischkowitz M. Cancer Risks Associated With Germline PALB2 Pathogenic Variants: An International Study of 524 Families. J Clin Oncol. 2020;38(7):674-685. DOI: 10.1200/JCO.19.01907
- Kleiblova P, Stolarova L, Krizova K, Lhota F, Hojny J, Zemankova P, Havranek O, Vocka M, Cerna M, Lhotova K, Borecka M, Janatova M, Soukupova J, Sevcik J, Zimovjanova M, Kotlas J, Panczak A, Vesela K, Cervenkova J, Schneiderova M, Burocziova M, Burdova K, Stranecky V, Foretova L, Machackova E, Tavanzis S, Kmoch S, Macurek L, Kleibl Z. Identification of deleterious germline CHEK2 mutations and their association with breast and ovarian cancer. Int J Cancer. 2019;145(7):1782-1797. DOI: 10.1002/ijc.32385
- Meulendijks D, Henricks LM, Sonke GS, Deenen MJ, Froehlich TK, Amstutz U, Largiadèr CR, Jennings BA, Marinaki AM, Sanderson JD, Kleibl Z, Kleiblova P, Schwab M, Zanger UM, Palles C, Tomlinson I, Gross E, van Kuilenburg AB, Punt CJ, Koopman M, Beijnen JH, Cats A, Schellens JH. Clinical relevance of DPYD variants c.1679T>G, c.1236G>A/HapB3, and c.1601G>A as predictors of severe fluoropyrimidine-associated toxicity: a systematic review and meta-analysis of individual patient data. Lancet Oncol. 2015;16(16):1639-50. DOI: 10.1016/S1470-2045(15)00286-7
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Libor Macůrek
(uzel Praha, Ústav molekulární genetiky AV ČR)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Genetické testování zárodečných linií
Klasifikace variant
Funkční analýzy
Analýzy RNA/splicing
Farmakogenomika