Proteinová homeostáza nádorů
Vedoucí skupiny: Petr Müller
Uzel Brno
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
Masarykův onkologický ústav
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 1 - Molekulární podstata nádorových chorob a molekulární cíle
VP 2 - Výzkum a vývoj protinádorových léčiv a terapeutických postupů
Z chaosu vychází řád: Porozumění proteotoxickému stresu u nádorů.
- Mise: Porozumění adaptaci nádorů na proteotoxický stres a identifikace nových terapeutických cílů využívajících proteostatické mechanismy.
Důležitou vlastností nádorové buňky jsou její vysoké nároky na udržování proteinové homeostázy. Nestabilita genomu, vysoká frekvence mutací a zvýšená proteosyntéza vedou k aktivaci stresové signalizace a zvýšené produkci chaperonů, na nichž se nádorové buňky stávají závislými. Cílem našeho výzkumného programu je analyzovat mechanismy vedoucí k aktivaci stresové odpovědi v nádorech, popsat mechanismy vedoucí k hyperaktivaci chaperonů a identifikovat nové cíle vhodné pro protinádorovou terapii.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Durech M, Trcka F, Man P, Blackburn EA, Hernychova L, Dvorakova P, Coufalova D, Kavan D, Vojtesek B, Muller P. Novel Entropically Driven Conformation-specific Interactions with Tomm34 Protein Modulate Hsp70 Protein Folding and ATPase Activities. Mol Cell Proteomics. 2016 May;15(5):1710-27. DOI: 10.1074/mcp.M116.058131
- Krejci A, Hupp TR, Lexa M, Vojtesek B, Muller P. Hammock: a hidden Markov model-based peptide clustering algorithm to identify protein-interaction consensus motifs in large datasets. Bioinformatics. 2016 Jan 1;32(1):9-16. DOI: 10.1093/bioinformatics/btv522
- Mistrik M, Skrott Z, Muller P, Panacek A, Hochvaldova L, Chroma K, Buchtova T, Vandova V, Kvitek L, Bartek J. Microthermal-induced subcellular-targeted protein damage in cells on plasmonic nanosilver-modified surfaces evokes a two-phase HSP-p97/VCP response. Nat Commun. 2021 Jan 29;12(1):713. DOI: 10.1038/s41467-021-20989-9
- Muller P, Ruckova E, Halada P, Coates PJ, Hrstka R, Lane DP, Vojtesek B. C-terminal phosphorylation of Hsp70 and Hsp90 regulates alternate binding to co-chaperones CHIP and HOP to determine cellular protein folding/degradation balances. Oncogene. 2013 Jun 20;32(25):3101-10. DOI: 10.1038/onc.2012.314
- Trcka F, Durech M, Vankova P, Vandova V, Simoncik O, Kavan D, Vojtesek B, Muller P, Man P. The interaction of the mitochondrial protein importer TOMM34 with HSP70 is regulated by TOMM34 phosphorylation and binding to 14-3-3 adaptors. J Biol Chem. 2020 Jul 3;295(27):8928-8944. DOI: 10.1074/jbc.RA120.012624
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Martin Mistrík
(uzel Olomouc, Lékařská fakulta UP/Ústav molekulární a translační medicíny LF UP)
Michal Hocek
(uzel Praha, Ústav oragnické chemie a biochemie AV ČR)
Pavel Bouchal
(uzel Brno, Přírodovědecká fakulta MU)
Pavel Dráber
(uzel Praha, Ústav molekulární genetiky AV ČR)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Metodické přístupy pro studium proteinů zahrnující produkci a purifikaci rekombinantních proteinů, studium proteinových komplexů s využitím funkční proteomiky a strukturní proteomiku využívající vodík-deuteriovou výměnu (HDX)
Syntetická biologie aplikovaná v tvorbě stabilních buněčných modelů využívající lentivirové expresní vektory, PiggyBac transpozony; anipulace genové exprese pomocí genových knockoutů nebo inducibilní genové exprese
Produkce, charakterizace a modifikace monoklonálních protilátek využívající phage display technologie, analýzu epitopu, konjugace protilátek fluorochromy, malými molekulami nebo enzymy
Analýza stresové odpovědi u nádorových buněk na úrovni mRNA, proteinů a buněk s využitím omických metod, life-cell imaging nebo průtokové cytometrie
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY
Síť českých biobank BBMRI.cz
Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování Czech-Bioimaging
Středoevropský technologický institut Masarykovy Univerzity CEITEC MU