Genomika a cirkulující biomarkery
Vedoucí skupiny: Josef Srovnal
Uzel Olomouc
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
Lékařská fakulta UP/Ústav molekulární a translační medicíny LF UP
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 3 - Biomarkery nádorových nemocí a diagnostika nádorových chorob
Najít jehlu v kupce sena a ještě provléct nit!
- Mise: Identifikovat cirkulující biomarkery nádorových nemocí s diagnostickým, prognostickým a prediktivním významem.
- Vize: Zavést a rozšířit koncept tekuté biopsie do rutinní klinické praxe.
Mezi velké výzvy v onkologii patří zlepšení sekundární prevence a časné diagnostiky se současným vývojem nových cílených léků pro zlepšení celkového přežití a kvality života pacientů. Klasická tkáňová biopsie je standardní diagnostickou metodou v onkologii, ale jejím významným omezením je anatomická lokalizace a heterogenita vyšetřovaného vzorku. Je také zatížena riziky vyplývajícími z její invazivní povahy, omezující její opakovatelnost. Naproti tomu tekutá biopsie představuje minimálně invazivní, komplexní a opakovatelný přístup k molekulární charakterizaci nádorů pomocí biomarkerů cirkulujících v periferní krvi.
V současnosti je nejvíce analyzovaným materiálem tekuté biopsie cirkulující volná nádorová DNA (ctDNA) a cirkulující nádorové buňky (CTC). Předmětem výzkumu jsou také extracelulární vezikuly a v nich obsažené nukleové kyseliny. Navzdory zřejmým přínosům však dosud nebyla tekutá biopsie v klinické praxi rutinně zavedena, a to především z důvodu nedostatečné standardizace molekulárních metod. Předmětem výzkumu této skupiny je implementace a standardizace komplexního testování genomické tekuté biopsie s využitím volných cirkulujících biomarkerů, jako jsou CTC, ctDNA nebo extracelulární vezikuly.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Slavik H, Balik V, Vrbkova J, Rehulkova A, Vaverka M, Hrabalek L, Ehrmann J, Vidlarova M, Gurska S, Hajduch M, Srovnal J. Identification of Meningioma Patients at High Risk of Tumor Recurrence Using MicroRNA Profiling. Neurosurgery. 2020 Oct 15;87(5):1055-1063. DOI: 10.1093/neuros/nyaa009
- Rehulkova A, Chudacek J, Prokopova A, Vidlarova M, Stranska J, Drabek J, Potockova J, Trojanec R, Vrbkova J, Skarda J, Bohanes T, Szkorupa M, Tolmaci B, Klein J, Srovnal J, Hajduch M. Clinical and prognostic significance of detecting CEA, EGFR, LunX, c-met and EpCAM mRNA-positive cells in the peripheral blood, tumor-draining blood and bone marrow of non-small cell lung cancer patients. Transl Lung Cancer Res. 2023 May 31;12(5):1034-1050. DOI: 10.21037/tlcr-22-801
- Slavik H, Balik V, Kokas FZ, Slavkovsky R, Vrbkova J, Rehulkova A, Lausova T, Ehrmann J, Gurska S, Uberall I, Hajduch M, Srovnal J. Transcriptomic Profiling Revealed Lnc-GOLGA6A-1 as a Novel Prognostic Biomarker of Meningioma Recurrence. Neurosurgery. 2022 Aug 1;91(2):360-369. DOI: 10.1227/neu.0000000000002026
- Stejskal P, Goodarzi H, Srovnal J, Hajdúch M, van ‚t Veer LJ, Magbanua MJM. Circulating tumor nucleic acids: biology, release mechanisms, and clinical relevance. Mol Cancer. 2023 Jan 21;22(1):15. DOI: 10.1186/s12943-022-01710-w
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Ondřej Slabý
(uzel Brno, Lékařská fakulta MU/CEITEC MU)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Poloautomatická detekce cirkulujících nádorových buněk
Genomické analýzy na úrovni single-cell a cirkulující volné DNA
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY
Národní infrastruktura pro translační medicínu EATRIS-CZ