Laboratoř hematoonkologie a kmenových buněk
Vedoucí skupiny: Tomáš Stopka
Uzel Praha
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
1. lékařská fakulta UK
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 5 - Translační onkologie: ověřovací klinické studie typu proof-of-concept
Kmenové buňky jsou mozkem nádoru!
Progrese leukemií souvisí s rezistencí nádorových buněk, jež je ideálním cílem zásahu nových terapií. Nicméně konkrétní molekuly, které rezistenci zprostředkovávají, je nutné nejen objevit a validovat na myších PDX modelech, ale současně se musí dostat co nejdříve do studijní léčby pacientů!
Jsme lékaři, přírodovědci a matematici zabývající se klonální evolucí nádorů, především schopností nádorových kmenových buněk unikat cílené terapii. Víme, že rezistence vede k přeprogramování genové exprese, změnám metabolismu, ale i k nastavení dalších procesů včetně redoxní homeostázy.
Využíváme nejmodernější technologie jako, je cílená proteomika, genomika či transgenní výzkum v myši. Dokážeme sledovat i přirozené či patologické modifikace bílkovin a používáme tyto technologie s cílem identifikovat molekulární procesy spojené s vývojem a progresí malignit a vznikem rezistence.
Spolupracujeme v rámci NÚVR, ale i se zahraničními vědci z celého světa, vychováváme studenty a účastníme se klinických aplikovaných projektů i v pacientských organizacích.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Turkova T, Kokavec J, Zikmund T, Dibus N, Pimkova K, Nemec D, Holeckova M, Ruskova L, Sedlacek R, Cermak L, Stopka T. Differential requirements for Smarca5 expression during hematopoietic stem cell commitment. Commun Biol. 2024 Feb 29;7(1):244. DOI: 10.1038/s42003-024-05917-z
- Stopka T, Minařík L, Dusilková N, Pešta M, Kulvait V, Špaček M, Zemanová Z, Kalousová M, Jonášová A. G-CSF plus azacitidine versus azacitidine alone for patients with high-risk myelodysplastic syndrome: academic, open label, randomized trial. Blood Cancer J. 2022 Jul 7;12(7):105. DOI: 10.1038/s41408-022-00698-2
- Kokavec J, Zikmund T, Savvulidi F, Kulvait V, Edelmann W, Skoultchi AI, Stopka T. The ISWI ATPase Smarca5 (Snf2h) Is Required for Proliferation and Differentiation of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells. Stem Cells. 2017 Jun;35(6):1614-1623. DOI: 10.1002/stem.2604
- Janostiak R, Rauniyar N, Lam TT, Ou J, Zhu LJ, Green MR, Wajapeyee N. MELK Promotes Melanoma Growth by Stimulating the NF-κB Pathway. Cell Rep. 2017 Dec 5;21(10):2829-2841. DOI: 10.1016/j.celrep.2017.11.033
- Petrak J, Ivanek R, Toman O, Cmejla R, Cmejlova J, Vyoral D, Zivny J, Vulpe CD. Déjà vu in proteomics. A hit parade of repeatedly identified differentially expressed proteins. Proteomics. 2008 May;8(9):1744-9. DOI: 10.1002/pmic.200700919
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Marek Mráz
(uzel Brno, CEITEC MU)
Milan Jakubek
(uzel Praha, 1. lékařská fakulta UK)
Pavel Klener
(uzel Praha, 1. lékařská fakulta UK)
Vladimír Divoký
(uzel Olomouc, Lékařská fakulta UP/Ústav molekulární a translační medicíny LF UP)
Zdeněk Hodný
(uzel Praha, Ústav molekulární genetiky AV ČR)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Live cell konfokální mikroskopie, průtoková cytometrie, sorting
Proteomická analýza buněk, tkání, tělních tekutin s využitím izotopů iTRAQ, TMT, SILAC
Detekce a kvantifikace na základě protilátek (western blotting a ELISA)
Sekvenování nové generace
Kryokonzervace tkání a separace buněk