Lukáš Trantírek

Nekódující genom

Bez základního výzkumu není žádných aplikací.

Vývoj alternativních terapeutických přístupů k inhibici receptorových tyrozinových kináz odpovědných za poruchy buněčné signalizace vedoucí k celé řadě onemocnění včetně rakoviny. Tento cíl je součástí projektu vedeného skupinou Dr. P. Krejčího na LF MU. Naše pracoviště se zaměřuje na vývoj inhibitorů založených na technologii DNA aptamerů.

Jednou z dalších částí našeho výzkumu je studium strukturního chování jednořetězových DNA fragmentů vyskytujících se v krevní plazmě. Cílem této části projektu je hledání nových principů pro diagnostiku rakoviny.

VYBRANÉ PUBLIKACE
  • Pipier A, Chetot T, Kalamatianou A, Martin N, Caroff M, Britton S, Chéron N, Trantírek L, Granzhan A, Monchaud D. Structural Optimization of Azacryptands for Targeting Three-Way DNA Junctions. Angew Chem Int Ed Engl. 2024 14:e202409780. DOI: 10.1002/anie.202409780
  • Víšková P, Ištvánková E, Ryneš J, Džatko Š, Loja T, Živković ML, Rigo R, El-Khoury R, Serrano-Chacón I, Damha MJ, González C, Mergny JL, Foldynová-Trantírková S, Trantírek L. In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells. Nat Commun. 2024 15(1):1992. DOI: 10.1038/s41467-024-46221-y
  • Luo Y, Živković ML, Wang J, Ryneš J, Foldynová-Trantírková S, Trantírek L, Verga D, Mergny JL. A sodium/potassium switch for G4-prone G/C-rich sequences. Nucleic Acids Res. 2024 52(1):448-461. DOI: 10.1093/nar/gkad1073

 

SPOLUPRÁCE V NÚVR
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE

Biomolekulární a in-cell NMR spektroskopie

ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY

Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii CIISB 

Sdílená laboratoř Buněčné zobrazování CELLIM

Národní infrastruktura pro translační medicínu EATRIS-CZ