Laboratorní centrum CLIP – Childhood Leukaemia Investigation Prague
Vedoucí skupiny: Jan Trka
Uzel Praha
DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ
2. lékařská fakulta UK
VÝZKUMNÝ PROGRAM
VP 1 - Molekulární podstata nádorových chorob a molekulární cíle
Přežít v českém systému podpory vědy!
- Mise: Molekulární diagnostika pro každé dítě s rakovinou.
- Vize: Optimální léčba pro každé dítě s rakovinou.
CLIP je jediné výzkumné a diagnostické centrum v České republice, které se primárně zaměřuje na nádory dětského věku a leukémii. Patří mezi výzkumná centra evropského standardu s kontinuální publikační činností v předních časopisech v oboru.
VYBRANÉ PUBLIKACE
- Zaliova M, Zuna J, Winkowska L, Janotova I, Skorepova J, Lukes J, Meyer C, Marschalek R, Novak Z, Domansky J, Stary J, Sramkova L, Trka J. Genomic DNA-based measurable residual disease monitoring in pediatric acute myeloid leukemia: unselected consecutive cohort study. Leukemia. 2024 Jan;38(1):21-30. DOI: 10.1038/s41375-023-02083-9
- Svaton M, Skotnicova A, Reznickova L, Rennerova A, Valova T, Kotrova M, van der Velden VHJ, Brüggemann M, Darzentas N, Langerak AW, Zuna J, Stary J, Trka J, Fronkova E. NGS better discriminates true MRD positivity for the risk stratification of childhood ALL treated on an MRD-based protocol. Blood. 2023 Feb 2;141(5):529-533. DOI: 10.1182/blood.2022017003
- Zuna J, Hovorkova L, Krotka J, Koehrmann A, Bardini M, Winkowska L, Fronkova E, Alten J, Koehler R, Eckert C, Brizzolara L, Trkova M, Stuchly J, Zimmermann M, De Lorenzo P, Valsecchi MG, Conter V, Stary J, Schrappe M, Biondi A, Trka J, Zaliova M, Cazzaniga G, Cario G. Minimal residual disease in BCR::ABL1-positive acute lymphoblastic leukemia: different significance in typical ALL and in CML-like disease. Leukemia. 2022 Dec;36(12):2793-2801. DOI: 10.1038/s41375-022-01668-0
- Misove A, Vicha A, Broz P, Vanova K, Sumerauer D, Stolova L, Sramkova L, Koblizek M, Zamecnik J, Kyncl M, Holubova Z, Liby P, Taborsky J, Benes V 3rd, Pernikova I, Jones DTW, Sill M, Stancokova T, Krskova L, Zapotocky M. Integrated genomic analysis reveals actionable targets in pediatric spinal cord low-grade gliomas. Acta Neuropathol Commun. 2022 Sep 26;10(1):143. DOI: 10.1186/s40478-022-01446-0
- Zaliova M, Stuchly J, Winkowska L, Musilova A, Fiser K, Slamova M, Starkova J, Vaskova M, Hrusak O, Sramkova L, Stary J, Zuna J, Trka J. Genomic landscape of pediatric B-other acute lymphoblastic leukemia in a consecutive European cohort. Haematologica. 2019 Jul;104(7):1396-1406. DOI: 10.3324/haematol.2018.204974
- Hrusak O, de Haas V, Stancikova J, Vakrmanova B, Janotova I, Mejstrikova E, Capek V, Trka J, Zaliova M, Luks A, Bleckmann K, Möricke A, Irving J, Konatkowska B, Alexander TB, Inaba H, Schmiegelow K, Stokley S, Zemanova Z, Moorman AV, Rossi JG, Felice MS, Dalla-Pozza L, Morales J, Dworzak M, Buldini B, Basso G, Campbell M, Cabrera ME, Marinov N, Elitzur S, Izraeli S, Luria D, Feuerstein T, Kolenova A, Svec P, Kreminska O, Rabin KR, Polychronopoulou S, da Costa E, Marquart HV, Kattamis A, Ratei R, Reinhardt D, Choi JK, Schrappe M, Stary J. International cooperative study identifies treatment strategy in childhood ambiguous lineage leukemia. Blood. 2018 Jul 19;132(3):264-276. DOI: 10.1182/blood-2017-12-821363
SPOLUPRÁCE V NÚVR
Tomáš Etrych
(uzel Praha, Ústav makromolekulární chemie AV ČR)
Vítězslav Bryja
(uzel Brno, Přírodovědecká fakulta MU)
SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
Průtoková cytometrie
Hmotnostní cytometrie
Molekulární genetika
Bulk a single-cell genomika
Metabolomika
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY
European Scientific foundation for Laboratory Hemato Oncology ESLHO