Ludmila Vodičková

Molekulární biologie nádorů: Biomarkery a rizikové faktory vzniku nádorových onemocnění

Vedoucí skupiny: Ludmila Vodičková
Uzel Praha

ludmila.vodickova@iem.cas.cz
webové stránky pracoviště

DOMOVSKÉ PRACOVIŠTĚ

Ústav experimentální medicíny AV ČR

VÝZKUMNÝ PROGRAM

VP 3 - Biomarkery nádorových nemocí a diagnostika nádorových chorob

Nádorová buňka svůj boj nikdy nevzdává!

ZAMĚŘENÍ A CÍLE VÝZKUMU
VYBRANÉ PUBLIKACE
EXPERTIZA A TECHNOLOGIE
SPOLUPRÁCE V NÚVR
ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR
  • Mise: Pomocí biomarkerů nádor zviditelnit a poznat jeho slabá místa.
  • Vize: Zmapovat rizikové faktory nádorových onemocnění a identifikovat molekulární biomarkery vzniku a rozvoje (progrese) nádorových onemocnění gastrointestinálního traktu a vybraných ženských nádorů.

Budeme stanovovat řadu parametrů charakterizujících modifikace genetické informace, tj. poškození DNA, nebo změny v regulaci genové exprese, včetně epigenetických charakteristik (exprese miRNA, metylace DNA) v souvislosti s genomickou instabilitou u nádorů gastrointestinálního traktu a vybraných ženských nádorů. Systematický přístup bude aplikován pro studium heritability a individuální vnímavosti vůči nádorovým onemocněním, především u nádorů tlustého střeva a konečníku a slinivky břišní. Budeme se soustřeďovat na interakce mezigenové (epistáza) a interakcí mezi genetickými a environmentálními faktory.

VYBRANÉ PUBLIKACE
  • Jungwirth J, Urbanova M, Boot A, Hosek P, Bendova P, Siskova A, Svec J, Kment M, Tumova D, Summerova S, Benes Z, Buchler T, Kohout P, Hucl T, Matej R, Vodickova L, van Wezel T, Vodicka P, Vymetalkova V. Mutational analysis of driver genes defines the colorectal adenoma: in situ carcinoma transition. Sci Rep. 2022 Feb 16;12(1):2570. DOI: 10.1038/s41598-022-06498-9
  • Vodicka P, Andera L, Opattova A, Vodickova L. The Interactions of DNA Repair, Telomere Homeostasis, and p53 Mutational Status in Solid Cancers: Risk, Prognosis, and Prediction. Cancers (Basel). 2021 Jan 27;13(3):479. DOI: 10.3390/cancers13030479
  • Bendova P, Pardini B, Susova S, Rosendorf J, Levy M, Skrobanek P, Buchler T, Kral J, Liska V, Vodickova L, Landi S, Soucek P, Naccarati A, Vodicka P, Vymetalkova V. Genetic variations in microRNA-binding sites of solute carrier transporter genes as predictors of clinical outcome in colorectal cancer. Carcinogenesis. 2021 Apr 17;42(3):378-394. DOI: 10.1093/carcin/bgaa136
  • Vodicka P, Polivkova Z, Sytarova S, Demova H, Kucerova M, Vodickova L, Polakova V, Naccarati A, Smerhovsky Z, Ambrus M, Cerna M, Hemminki K. Chromosomal damage in peripheral blood lymphocytes of newly diagnosed cancer patients and healthy controls. Carcinogenesis. 2010 Jul;31(7):1238-41. DOI: 10.1093/carcin/bgq056
  • Tsilidis KK, Papadimitriou N, Dimou N, Gill D, Lewis SJ, Martin RM, Murphy N, Markozannes G, Zuber V, Cross AJ, Burrows K, Lopez DS, Key TJ, Travis RC, Perez-Cornago A, Hunter DJ, van Duijnhoven FJB, Albanes D, Arndt V, Berndt SI, Bézieau S, Bishop DT, Boehm J, Brenner H, Burnett-Hartman A, Campbell PT, Casey G, Castellví-Bel S, Chan AT, Chang-Claude J, de la Chapelle A, Figueiredo JC, Gallinger SJ, Giles GG, Goodman PJ, Gsur A, Hampe J, Hampel H, Hoffmeister M, Jenkins MA, Keku TO, Kweon SS, Larsson SC, Le Marchand L, Li CI, Li L, Lindblom A, Martín V, Milne RL, Moreno V, Nan H, Nassir R, Newcomb PA, Offit K, Pharoah PDP, Platz EA, Potter JD, Qi L, Rennert G, Sakoda LC, Schafmayer C, Slattery ML, Snetselaar L, Schenk J, Thibodeau SN, Ulrich CM, Van Guelpen B, Harlid S, Visvanathan K, Vodickova L, Wang H, White E, Wolk A, Woods MO, Wu AH, Zheng W, Bueno-de-Mesquita B, Boutron-Ruault MC, Hughes DJ, Jakszyn P, Kühn T, Palli D, Riboli E, Giovannucci EL, Banbury BL, Gruber SB, Peters U, Gunter MJ. Genetically predicted circulating concentrations of micronutrients and risk of colorectal cancer among individuals of European descent: a Mendelian randomization study. Am J Clin Nutr. 2021 Jun 1;113(6):1490-1502. DOI: 10.1093/ajcn/nqab003
SPOLUPRÁCE V NÚVR

Jiří Neužil
(uzel Praha, Biotechnologický ústav AV ČR)

Kari Hemminki
(uzel Praha, Lékařská fakulta UK v Plzni)

Ondřej Slabý
(uzel Brno, Lékařská fakulta MU/CEITEC MU)

Pavel Rössner
(uzel Praha, Ústav experimentální medicíny AV ČR)

Pavel Souček
(uzel Praha, Lékařská fakulta UK v Plzni)

Pavel Vodička
(uzel Praha, Ústav experimentální medicíny AV ČR)

Václav Liška
(uzel Praha, Lékařská fakulta UK v Plzni)

Zdeněk Kleibl
(uzel Praha, 1. lékařská fakulta UK)

SPECIALIZOVANÁ EXPERTIZA A TECHNOLOGIE

Digitální PCR

Fluorescenční mikroskop

ZAPOJENÍ DO INFRASTRUKTUR, SPOLUPRÁCE S VÝZKUMNÝMI CENTRY

Národní infrastruktura pro translační medicínu EATRIS-CZ